Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms