Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ5

Slc22a12, Solute carrier family 22 member 12, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a12Q8CFZ5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a12Q8CFZ5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms