Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms