Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Usp27Q8CEG8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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