Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms