Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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