Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Y0

4930572O03Rik, RIKEN cDNA 4930572O03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930572O03RikQ8C5Y0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms