Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim35Q8C006 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim35Q8C006 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim35Q8C006 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim35Q8C006 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim35Q8C006 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim35Q8C006 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim35Q8C006 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim35Q8C006 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim35Q8C006 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim35Q8C006 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim35Q8C006 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim35Q8C006 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim35Q8C006 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim35Q8C006 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim35Q8C006 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim35Q8C006 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim35Q8C006 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim35Q8C006 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Trim35Q8C006 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trim35Q8C006 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 AC118750.1-201ENSMUST00000214163 675 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim35Q8C006 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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