Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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