Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA0

Lrfn5, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn5Q8BXA0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrfn5Q8BXA0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms