Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Catsper4Q8BVN3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms