Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdcl3Q8BVF2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms