Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTW3

Exosc6, Exosome complex component MTR3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc6Q8BTW3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc6Q8BTW3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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