Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU1

Cfap20, Cilia- and flagella-associated protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap20Q8BTU1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms