Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms