Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pbrm1Q8BSQ9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms