Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP97

Rhbdd3, Rhomboid domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd3Q8BP97 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms