Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLI4

Dse, Dermatan-sulfate epimerase, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DseQ8BLI4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
DseQ8BLI4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms