Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Vipas39Q8BGQ1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Vipas39Q8BGQ1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Vipas39Q8BGQ1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Vipas39Q8BGQ1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Vipas39Q8BGQ1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Vipas39Q8BGQ1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Vipas39Q8BGQ1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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