Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Best2Q8BGM5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Best2Q8BGM5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms