Protein–RNA interactions for Protein: Q80UB0

Testin-2, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80UB0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q80UB0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q80UB0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q80UB0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q80UB0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q80UB0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q80UB0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q80UB0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q80UB0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q80UB0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q80UB0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q80UB0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q80UB0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q80UB0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q80UB0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q80UB0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q80UB0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q80UB0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q80UB0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q80UB0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q80UB0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q80UB0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q80UB0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q80UB0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q80UB0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q80UB0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q80UB0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q80UB0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q80UB0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q80UB0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q80UB0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q80UB0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q80UB0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q80UB0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q80UB0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q80UB0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q80UB0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q80UB0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q80UB0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q80UB0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q80UB0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q80UB0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q80UB0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q80UB0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q80UB0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q80UB0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q80UB0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q80UB0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q80UB0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q80UB0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q80UB0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q80UB0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q80UB0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q80UB0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q80UB0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q80UB0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q80UB0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q80UB0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q80UB0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q80UB0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q80UB0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q80UB0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q80UB0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q80UB0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q80UB0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q80UB0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q80UB0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q80UB0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q80UB0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q80UB0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q80UB0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q80UB0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q80UB0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q80UB0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q80UB0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q80UB0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q80UB0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q80UB0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q80UB0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q80UB0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q80UB0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q80UB0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q80UB0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q80UB0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q80UB0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q80UB0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q80UB0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q80UB0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q80UB0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q80UB0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q80UB0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q80UB0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q80UB0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q80UB0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q80UB0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q80UB0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q80UB0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q80UB0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q80UB0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q80UB0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms