Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pja2Q80U04 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms