Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
NischQ80TM9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms