Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms