Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ckap2lQ7TS74 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms