Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms