Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc6aQ78XR0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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