Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Syne2Q6ZWQ0 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms