Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms