Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorQ6ZPI3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms