Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atp8b3Q6UQ17 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp8b3Q6UQ17 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp8b3Q6UQ17 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Atp8b3Q6UQ17 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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Atp8b3Q6UQ17 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Atp8b3Q6UQ17 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Atp8b3Q6UQ17 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Atp8b3Q6UQ17 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Atp8b3Q6UQ17 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms