Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms