Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrp12Q6P5B0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rrp12Q6P5B0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms