Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HelbQ6NVF4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms