Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzrn3Q69ZS0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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