Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms