Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkciQ62074 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkciQ62074 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkciQ62074 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkciQ62074 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkciQ62074 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkciQ62074 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkciQ62074 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkciQ62074 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkciQ62074 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkciQ62074 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkciQ62074 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkciQ62074 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms