Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itga6Q61739 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itga6Q61739 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itga6Q61739 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itga6Q61739 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itga6Q61739 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itga6Q61739 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itga6Q61739 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga6Q61739 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga6Q61739 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms