Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms