Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AcanQ61282 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AcanQ61282 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AcanQ61282 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AcanQ61282 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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