Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp7Q60973 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms