Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms