Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PmelQ60696 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmelQ60696 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms