Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prdm1Q60636 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms