Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJV6

Lmtk3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk3Q5XJV6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lmtk3Q5XJV6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lmtk3Q5XJV6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmtk3Q5XJV6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmtk3Q5XJV6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmtk3Q5XJV6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmtk3Q5XJV6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms