Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4E2

Repin1, Replication initiator 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Repin1Q5U4E2 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Tceal9-202ENSMUST00000113115 888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Repin1Q5U4E2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Repin1Q5U4E2 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms