Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms