Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85aQ5SP85 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms