Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms