Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Trappc1Q5NCF2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Trappc1Q5NCF2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Trappc1Q5NCF2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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